东南大学医院隶属于中央直管、教育部直属的“985工程”和“211工程”重点建设高校——东南大学。是经南京市卫生健康委批准注册，集医疗、科研、预防保健、健康教育、公共卫生服务为一体的综合性一级甲等医院。医院2005年成为大学直属单位，是江苏省高等教育学会卫生健康研究会副理事长单位、南京市企事业医院管理协会常务理事单位。

医院始建于1961年，在60年的发展历程中，隶属关系几经变迁，内设机构不断调整，组织架构日趋完善。2000年4月，以原东南大学医院为主体，合并南京铁道医学院卫生所、南京交通专科学校卫生所、南京地质学校医务室，成立了新的东南大学医院。医院设有四牌楼、九龙湖、丁家桥三个校区医疗点，总建筑面积10000余平方米，核定床位60张，形成以条为主、条块结合，面向三校区服务的组织架构和管理模式。

医院现有职工98人，其中高级职称18人，中级职称35人，硕士以上学位13人，临床医生均获得了全科医生资格。设有内科、外科、妇科、中医科、康复科、五官科、眼科、皮肤科、口腔科、药剂科、检验科、放射科、B超室、心电图室、护理部等15个临床、医技科室，设有行政办公室、预防保健科、公费医疗办公室、财务科、信息科、计划生育办公室等6个行政职能科室，年门诊量15万人次左右。

近年来，办院条件不断改善，实现诊疗、健康档案、物资、财务全信息化管理。目前拥有DR、数字化X摄像系统、多普勒彩色超声诊断系统、全自动生化仪、全自动血流变仪、血球仪、糖化血红蛋白仪、除颤监护仪、动态血压监测仪、动态心电图、十二导心电图机、颈腰椎牵引床、微波治疗仪等万元以上大中小型医疗设备100余台。

医院科研创新能力稳步提升，课题经费、科研成果与高水平论文数量不断增加。近五年获得市厅级以上课题6项，其中国家自然科学基金1项、江苏省社会科学基金1项、江苏省教育科学“十二五”、“十三五”规划重点资助项目2项。近五年，累计在国内外期刊发表论文30余篇，其中SCI收录4篇，CSCD收录近20篇。主编、副主编或参编医疗、健康教育、卫生管理相关专著10余部。参与了《中国学校结核病防控指南(2020版)》《江苏省学校和托幼机构急性传染病预防控制工作指引》等行业标准的编制。

医院坚持以“预防为主，防治结合”的方针，以“大专科，强综合”的战略布局，立足学校，面向社会，不断提升医疗服务质量。着力推进信息化建设，不断完善制度建设，强化公共卫生、健康教育、健康管理、巡诊保健、公费医疗管理等服务工作，发展口腔、中医、康复等特色科室，探索构建区域医疗联合体，开设专家门诊，畅通门急诊转诊绿色通道。

近年来，医院在上级教育、卫生行政主管部门组织的检查评比中均取得优异的成绩，先后获“全国高校体育卫生先进单位”、“南京市计划生育工作先进单位”、“南京市健康教育工作先进单位”、“全省高校卫生系统新冠肺炎防控工作先进集体”等称号，2020年1名同志获“全省抗击新冠肺炎疫情先进个人”荣誉称号，受省委省政府表彰。

迈进新时代，阔步新征程。今日的东南大学医院，将秉承和践行“止于至善”校训，树立一流意识、围绕一流目标、贯彻一流标准，坚持以“关爱师生，奉献社会，提供优质、便捷、高效的医疗保健服务”为宗旨，全面深化综合改革，修仁心之德，强仁术之技，努力建成国内一流、师生满意的高校医院，为平安校园建设和广大师生员工的健康“保驾护航”。